Wszechświat Sonica pogrąża się w chaosie, gdy tajemnicza nowa moc wchodzi w życie, tworząc „dziury czasowe”, które zabierają Sonica i jego przyjaciół w przeszłość. Tam Sonic spotyka kilka bardzo znanych postaci ze swojej przeszłości, w tym młodszą, klasyczną wersję samego siebie! Teraz muszą pokonać swoich wrogów, uratować przyjaciół i dowiedzieć się, kto stoi za tym diabolicznym czynem.
