Upłynęło 20 lat od czasu, od wypadków opisanych w pierwszej części Deus Ex i w połowie XXI wieku, na Ziemi toczy się zacięta walka o podstawowe potrzeby do przetrwania jedzenie, wodę, przywrócenie porządku i oczyszczenie świata ze skutków biologicznej i nano-technologicznej katastrofy. Ten stan przyczynia się do powstania wielu frakcji religijnych i politycznych, które chcą na swój sposób ukształtować nowe prawa. Jednym z mieszkańców ziemi jest Alex D. Wciel się w tą tajemniczą postać i odkryj sekrety najpotężniejszych ludzi na Ziemi i znajdź rozwiązanie zagadki własnej tożsamości. Spraw, aby ludzkość podniosła się z popiołów Charakterystyczne cechy:
Dynamiczna gra fabularna, z elementami strzelanki pierwszoosobowej. Stwórz własną postać w stylu RPG i wyposaż ją w nano-modyfikacje i odpowiedni sprzęt. Możliwość działania z ukrycia wykorzystaj ciemności i działaj po cichu, aby pokonać przeciwników. Sam decydujesz o sposobie gry problemy można rozwiązywać na wiele sposobów. Możliwość rozwiązywania konfliktów bez użycia przemocy etyczne postępowanie może przynieść wiele korzyści.
Duża ilość interesujących opcji i zdolności gracza od wyposażenia przez specjalne modyfikacje ciała. Dostosuj własne ciało do swych potrzeb przenikaj ściany wzrokiem, skacz na niesamowite wysokości, szybciej regeneruj siły, albo stań się niewykrywalny dla radaru. Dynamiczna, nieliniowa fabuła z wieloma możliwościami przebiegu akcji, zależnymi od poczynań gracza. Niespotykana wolność wyboru sposobu gry. Zaawansowana sztuczna inteligencja przeciwników ludzie i inne stworzenia współpracują ze sobą w czasie ataków, wykorzystując opcje skoordynowanych ataków i poszukując naturalnych osłon.
