Rządowa decyzja objęcia Avengers nadzorem, sprawia, że najlepsi przyjaciele Kapitan Ameryka (Chris Evans) i Iron Man (Robert Downey Jr.) stają się zaciekłymi wrogami. Pozostali członkowie drużyny muszą zdecydować komu okazać lojalność. Do gry włączają się tajemnicze czarne charaktery i nowi sprzymierzeńcy.
