Akcja przenosi się do Sanktuarium, gdzie znajduje się grobowiec Wiedźmy... Licealista Subaru Natsuki został przeniesiony do innego świata. Otrzymał przy tym tylko jedną, wyjątkową moc - moc powrotu przez śmierć. Udało mu się pokonać Arcybiskupa Lenistwa kultu Wiedźmy i pogodzić z Emilią. Razem z półelfką ruszają do Sanktuarium, gdzie czekają na nich Roswaal i Ram.