Wytoczenie ciężkich dział wydawało się dość proste, tyle że Stroggowie nie dali się zaskoczyć. Wraz z kilkoma komandosami znalazłeś się w grupie szczęściarzy. Udało się wam dotrzeć na dół w jednym kawałku i utrzymać kontakt z flotą. "Gravity Well", najnowsza broń Stroggów w ich antyludzkim arsenale, już działa. Ziemska flota krąży wokół planety Stroggos, ale przetrwało tylko 5% sił naziemnych i liczba ta kurczy się z każdą sekundą.
Otrzymujesz więc nowe rozkazy: uwolnić towarzyszy, zniszczyć Gravity Well. Nowi wrogowie - Stalker, wieżyczki, Daedalus, Medic Commander, Carrier i Black Widow. 14 całkiem nowych poziomów plus 10 nowych poziomów dla trybu deathmatch. Nowe wzmocnienia – specjalnie dla trybu deathmatch:
Vengeance Sphere, Hunter Sphere i Anti-matter bomb. Nowe uzbrojenie – Chainsaw (piła łańcuchowa), ETF Rifle i Plasma Beam.